Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHA3P29320 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA3P29320 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHA3P29320 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms