Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCD3P28288 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABCD3P28288 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCD3P28288 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms