Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB9P28065 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB9P28065 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms