Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMA4P25789 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMA4P25789 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA4P25789 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms