Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPH2P23942 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRPH2P23942 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPH2P23942 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms