Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KB1P23443 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KB1P23443 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms