Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ME2P23368 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME2P23368 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME2P23368 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME2P23368 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME2P23368 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME2P23368 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ME2P23368 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME2P23368 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME2P23368 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ME2P23368 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME2P23368 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME2P23368 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME2P23368 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME2P23368 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME2P23368 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME2P23368 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME2P23368 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME2P23368 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME2P23368 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME2P23368 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME2P23368 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME2P23368 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME2P23368 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME2P23368 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME2P23368 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ME2P23368 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME2P23368 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME2P23368 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME2P23368 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME2P23368 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME2P23368 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME2P23368 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME2P23368 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME2P23368 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME2P23368 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME2P23368 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ME2P23368 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME2P23368 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME2P23368 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ME2P23368 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ME2P23368 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ME2P23368 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ME2P23368 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ME2P23368 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME2P23368 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME2P23368 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME2P23368 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ME2P23368 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME2P23368 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME2P23368 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME2P23368 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME2P23368 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME2P23368 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME2P23368 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME2P23368 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME2P23368 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME2P23368 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ME2P23368 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME2P23368 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME2P23368 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ME2P23368 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME2P23368 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME2P23368 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME2P23368 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME2P23368 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME2P23368 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME2P23368 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME2P23368 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME2P23368 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME2P23368 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME2P23368 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME2P23368 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME2P23368 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME2P23368 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME2P23368 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME2P23368 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME2P23368 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME2P23368 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME2P23368 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME2P23368 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME2P23368 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME2P23368 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME2P23368 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME2P23368 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ME2P23368 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME2P23368 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME2P23368 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME2P23368 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME2P23368 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME2P23368 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME2P23368 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME2P23368 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME2P23368 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME2P23368 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME2P23368 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME2P23368 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME2P23368 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ME2P23368 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ME2P23368 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms