Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EFNA1P20827 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNA1P20827 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNA1P20827 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms