Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT4P19013 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT4P19013 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT4P19013 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT4P19013 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT4P19013 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT4P19013 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT4P19013 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT4P19013 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT4P19013 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT4P19013 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT4P19013 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT4P19013 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT4P19013 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT4P19013 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT4P19013 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT4P19013 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT4P19013 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT4P19013 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT4P19013 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT4P19013 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT4P19013 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT4P19013 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT4P19013 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT4P19013 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT4P19013 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT4P19013 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT4P19013 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT4P19013 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT4P19013 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT4P19013 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT4P19013 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT4P19013 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT4P19013 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT4P19013 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT4P19013 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT4P19013 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT4P19013 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT4P19013 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT4P19013 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT4P19013 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT4P19013 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT4P19013 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT4P19013 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT4P19013 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT4P19013 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT4P19013 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT4P19013 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT4P19013 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT4P19013 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT4P19013 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT4P19013 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT4P19013 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT4P19013 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT4P19013 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT4P19013 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT4P19013 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT4P19013 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT4P19013 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT4P19013 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT4P19013 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT4P19013 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT4P19013 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT4P19013 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT4P19013 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT4P19013 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT4P19013 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT4P19013 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT4P19013 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT4P19013 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT4P19013 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT4P19013 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT4P19013 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT4P19013 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT4P19013 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT4P19013 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT4P19013 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT4P19013 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT4P19013 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT4P19013 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT4P19013 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT4P19013 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT4P19013 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT4P19013 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT4P19013 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT4P19013 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT4P19013 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT4P19013 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT4P19013 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT4P19013 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT4P19013 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT4P19013 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT4P19013 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT4P19013 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KRT4P19013 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT4P19013 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT4P19013 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT4P19013 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT4P19013 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT4P19013 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 883.4 ms