Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZSCAN20P17040 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZSCAN20P17040 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZSCAN20P17040 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms