Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPCAMP16422 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPCAMP16422 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms