Protein–RNA interactions for Protein: P16035

TIMP2, Metalloproteinase inhibitor 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP2P16035 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TIMP2P16035 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIMP2P16035 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIMP2P16035 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TIMP2P16035 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMP2P16035 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMP2P16035 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMP2P16035 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMP2P16035 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIMP2P16035 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms