Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD46P15529 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD46P15529 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD46P15529 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD46P15529 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD46P15529 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD46P15529 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CD46P15529 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD46P15529 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD46P15529 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD46P15529 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD46P15529 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD46P15529 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD46P15529 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD46P15529 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CD46P15529 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CD46P15529 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CD46P15529 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD46P15529 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CD46P15529 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD46P15529 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD46P15529 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD46P15529 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD46P15529 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD46P15529 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD46P15529 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD46P15529 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CD46P15529 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CD46P15529 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD46P15529 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CD46P15529 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD46P15529 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD46P15529 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CD46P15529 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD46P15529 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CD46P15529 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD46P15529 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD46P15529 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD46P15529 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CD46P15529 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CD46P15529 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD46P15529 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CD46P15529 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD46P15529 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CD46P15529 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD46P15529 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD46P15529 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD46P15529 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD46P15529 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD46P15529 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CD46P15529 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD46P15529 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD46P15529 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD46P15529 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD46P15529 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CD46P15529 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD46P15529 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD46P15529 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD46P15529 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD46P15529 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD46P15529 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CD46P15529 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD46P15529 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD46P15529 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD46P15529 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CD46P15529 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CD46P15529 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD46P15529 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CD46P15529 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD46P15529 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD46P15529 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD46P15529 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD46P15529 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD46P15529 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD46P15529 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD46P15529 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD46P15529 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD46P15529 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD46P15529 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD46P15529 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD46P15529 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD46P15529 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD46P15529 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD46P15529 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD46P15529 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD46P15529 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD46P15529 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD46P15529 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD46P15529 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD46P15529 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD46P15529 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD46P15529 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CD46P15529 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD46P15529 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD46P15529 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD46P15529 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD46P15529 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD46P15529 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD46P15529 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD46P15529 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms