Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NID1P14543 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NID1P14543 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NID1P14543 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NID1P14543 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NID1P14543 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NID1P14543 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NID1P14543 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NID1P14543 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NID1P14543 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NID1P14543 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NID1P14543 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NID1P14543 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NID1P14543 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NID1P14543 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NID1P14543 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NID1P14543 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NID1P14543 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NID1P14543 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NID1P14543 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NID1P14543 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NID1P14543 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NID1P14543 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NID1P14543 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NID1P14543 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NID1P14543 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NID1P14543 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NID1P14543 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NID1P14543 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NID1P14543 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NID1P14543 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NID1P14543 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NID1P14543 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NID1P14543 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NID1P14543 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NID1P14543 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NID1P14543 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NID1P14543 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NID1P14543 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NID1P14543 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NID1P14543 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NID1P14543 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NID1P14543 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NID1P14543 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NID1P14543 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NID1P14543 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NID1P14543 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NID1P14543 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NID1P14543 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NID1P14543 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NID1P14543 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NID1P14543 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NID1P14543 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NID1P14543 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NID1P14543 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NID1P14543 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NID1P14543 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NID1P14543 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NID1P14543 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NID1P14543 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NID1P14543 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NID1P14543 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NID1P14543 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NID1P14543 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NID1P14543 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NID1P14543 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NID1P14543 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NID1P14543 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NID1P14543 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NID1P14543 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NID1P14543 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NID1P14543 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NID1P14543 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NID1P14543 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NID1P14543 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NID1P14543 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NID1P14543 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NID1P14543 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NID1P14543 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NID1P14543 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NID1P14543 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NID1P14543 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NID1P14543 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NID1P14543 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NID1P14543 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NID1P14543 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NID1P14543 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NID1P14543 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NID1P14543 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NID1P14543 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NID1P14543 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NID1P14543 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NID1P14543 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NID1P14543 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NID1P14543 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NID1P14543 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NID1P14543 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NID1P14543 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NID1P14543 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NID1P14543 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms