Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNB1P11230 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNB1P11230 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNB1P11230 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms