Protein–RNA interactions for Protein: P0CG37

CFC1, Cryptic protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1P0CG37 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFC1P0CG37 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CFC1P0CG37 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms