Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRR35P0CG20 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRR35P0CG20 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRR35P0CG20 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms