Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI1P08151 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI1P08151 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI1P08151 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI1P08151 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI1P08151 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI1P08151 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI1P08151 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI1P08151 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI1P08151 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI1P08151 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI1P08151 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI1P08151 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI1P08151 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI1P08151 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI1P08151 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI1P08151 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI1P08151 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI1P08151 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI1P08151 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI1P08151 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI1P08151 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI1P08151 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI1P08151 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI1P08151 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GLI1P08151 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI1P08151 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI1P08151 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI1P08151 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI1P08151 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GLI1P08151 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI1P08151 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI1P08151 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI1P08151 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI1P08151 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GLI1P08151 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI1P08151 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI1P08151 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI1P08151 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI1P08151 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI1P08151 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI1P08151 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI1P08151 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI1P08151 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI1P08151 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI1P08151 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI1P08151 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI1P08151 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI1P08151 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI1P08151 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI1P08151 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI1P08151 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI1P08151 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI1P08151 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI1P08151 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI1P08151 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI1P08151 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI1P08151 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI1P08151 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI1P08151 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI1P08151 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI1P08151 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI1P08151 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI1P08151 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI1P08151 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI1P08151 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI1P08151 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI1P08151 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI1P08151 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI1P08151 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI1P08151 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI1P08151 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI1P08151 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI1P08151 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI1P08151 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GLI1P08151 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GLI1P08151 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI1P08151 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI1P08151 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI1P08151 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI1P08151 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI1P08151 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI1P08151 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI1P08151 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI1P08151 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI1P08151 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI1P08151 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI1P08151 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI1P08151 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI1P08151 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI1P08151 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI1P08151 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI1P08151 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI1P08151 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI1P08151 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI1P08151 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI1P08151 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI1P08151 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI1P08151 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI1P08151 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms