Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLK3P07288 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLK3P07288 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLK3P07288 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLK3P07288 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLK3P07288 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLK3P07288 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLK3P07288 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLK3P07288 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLK3P07288 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLK3P07288 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLK3P07288 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLK3P07288 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLK3P07288 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLK3P07288 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLK3P07288 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLK3P07288 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLK3P07288 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLK3P07288 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLK3P07288 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLK3P07288 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLK3P07288 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLK3P07288 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLK3P07288 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLK3P07288 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLK3P07288 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLK3P07288 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLK3P07288 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLK3P07288 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLK3P07288 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLK3P07288 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLK3P07288 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLK3P07288 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLK3P07288 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLK3P07288 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLK3P07288 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLK3P07288 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLK3P07288 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLK3P07288 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLK3P07288 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLK3P07288 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLK3P07288 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLK3P07288 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLK3P07288 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLK3P07288 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLK3P07288 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLK3P07288 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLK3P07288 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLK3P07288 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLK3P07288 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLK3P07288 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLK3P07288 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLK3P07288 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLK3P07288 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLK3P07288 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLK3P07288 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLK3P07288 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLK3P07288 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLK3P07288 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLK3P07288 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLK3P07288 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLK3P07288 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLK3P07288 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLK3P07288 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLK3P07288 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLK3P07288 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLK3P07288 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLK3P07288 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLK3P07288 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLK3P07288 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLK3P07288 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLK3P07288 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KLK3P07288 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLK3P07288 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KLK3P07288 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLK3P07288 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLK3P07288 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLK3P07288 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLK3P07288 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLK3P07288 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLK3P07288 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLK3P07288 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLK3P07288 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLK3P07288 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLK3P07288 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLK3P07288 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLK3P07288 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLK3P07288 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLK3P07288 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLK3P07288 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLK3P07288 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLK3P07288 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLK3P07288 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLK3P07288 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLK3P07288 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLK3P07288 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLK3P07288 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLK3P07288 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLK3P07288 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLK3P07288 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms