Protein–RNA interactions for Protein: P07202

TPO, Thyroid peroxidase, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPOP07202 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPOP07202 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPOP07202 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPOP07202 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPOP07202 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TPOP07202 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPOP07202 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPOP07202 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPOP07202 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPOP07202 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPOP07202 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPOP07202 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TPOP07202 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPOP07202 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPOP07202 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TPOP07202 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPOP07202 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPOP07202 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPOP07202 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPOP07202 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPOP07202 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPOP07202 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPOP07202 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPOP07202 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPOP07202 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TPOP07202 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TPOP07202 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TPOP07202 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPOP07202 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TPOP07202 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPOP07202 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TPOP07202 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPOP07202 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TPOP07202 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPOP07202 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TPOP07202 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPOP07202 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPOP07202 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TPOP07202 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPOP07202 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPOP07202 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPOP07202 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TPOP07202 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPOP07202 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPOP07202 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPOP07202 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPOP07202 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPOP07202 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TPOP07202 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPOP07202 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPOP07202 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPOP07202 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPOP07202 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPOP07202 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPOP07202 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPOP07202 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPOP07202 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPOP07202 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TPOP07202 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPOP07202 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPOP07202 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPOP07202 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPOP07202 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPOP07202 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPOP07202 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPOP07202 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPOP07202 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPOP07202 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPOP07202 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPOP07202 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TPOP07202 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPOP07202 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPOP07202 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPOP07202 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TPOP07202 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPOP07202 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPOP07202 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPOP07202 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TPOP07202 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPOP07202 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPOP07202 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPOP07202 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPOP07202 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPOP07202 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPOP07202 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPOP07202 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPOP07202 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPOP07202 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPOP07202 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TPOP07202 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPOP07202 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPOP07202 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPOP07202 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPOP07202 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPOP07202 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TPOP07202 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPOP07202 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPOP07202 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPOP07202 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TPOP07202 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms