Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ITGAVP06756 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ITGAVP06756 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms