Protein–RNA interactions for Protein: P06400

RB1, Retinoblastoma-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1P06400 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RB1P06400 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RB1P06400 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RB1P06400 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RB1P06400 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RB1P06400 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RB1P06400 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RB1P06400 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RB1P06400 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RB1P06400 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RB1P06400 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RB1P06400 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RB1P06400 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RB1P06400 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RB1P06400 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RB1P06400 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RB1P06400 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RB1P06400 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RB1P06400 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RB1P06400 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RB1P06400 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RB1P06400 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RB1P06400 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RB1P06400 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RB1P06400 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RB1P06400 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RB1P06400 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RB1P06400 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RB1P06400 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RB1P06400 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RB1P06400 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RB1P06400 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RB1P06400 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RB1P06400 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RB1P06400 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RB1P06400 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RB1P06400 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RB1P06400 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RB1P06400 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RB1P06400 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RB1P06400 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RB1P06400 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RB1P06400 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RB1P06400 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RB1P06400 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RB1P06400 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RB1P06400 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RB1P06400 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RB1P06400 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RB1P06400 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RB1P06400 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RB1P06400 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RB1P06400 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RB1P06400 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RB1P06400 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RB1P06400 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RB1P06400 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RB1P06400 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RB1P06400 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RB1P06400 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RB1P06400 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RB1P06400 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RB1P06400 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RB1P06400 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RB1P06400 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RB1P06400 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RB1P06400 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RB1P06400 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RB1P06400 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RB1P06400 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RB1P06400 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RB1P06400 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RB1P06400 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RB1P06400 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RB1P06400 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RB1P06400 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RB1P06400 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RB1P06400 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RB1P06400 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RB1P06400 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RB1P06400 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RB1P06400 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RB1P06400 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RB1P06400 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RB1P06400 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RB1P06400 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RB1P06400 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RB1P06400 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RB1P06400 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RB1P06400 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RB1P06400 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RB1P06400 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RB1P06400 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RB1P06400 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RB1P06400 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RB1P06400 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RB1P06400 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RB1P06400 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RB1P06400 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RB1P06400 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms