Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDN1P05305 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EDN1P05305 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDN1P05305 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDN1P05305 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EDN1P05305 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDN1P05305 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EDN1P05305 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDN1P05305 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EDN1P05305 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDN1P05305 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDN1P05305 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EDN1P05305 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDN1P05305 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDN1P05305 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDN1P05305 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDN1P05305 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDN1P05305 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDN1P05305 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDN1P05305 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EDN1P05305 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDN1P05305 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDN1P05305 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDN1P05305 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDN1P05305 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDN1P05305 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDN1P05305 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EDN1P05305 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDN1P05305 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDN1P05305 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDN1P05305 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDN1P05305 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EDN1P05305 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDN1P05305 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDN1P05305 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDN1P05305 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDN1P05305 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDN1P05305 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EDN1P05305 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDN1P05305 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EDN1P05305 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EDN1P05305 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDN1P05305 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDN1P05305 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDN1P05305 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDN1P05305 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDN1P05305 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDN1P05305 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDN1P05305 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDN1P05305 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EDN1P05305 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDN1P05305 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDN1P05305 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDN1P05305 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDN1P05305 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDN1P05305 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EDN1P05305 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDN1P05305 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDN1P05305 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EDN1P05305 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDN1P05305 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDN1P05305 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDN1P05305 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDN1P05305 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDN1P05305 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDN1P05305 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDN1P05305 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDN1P05305 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDN1P05305 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDN1P05305 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EDN1P05305 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDN1P05305 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDN1P05305 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDN1P05305 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDN1P05305 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDN1P05305 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDN1P05305 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDN1P05305 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDN1P05305 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDN1P05305 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDN1P05305 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDN1P05305 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDN1P05305 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EDN1P05305 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDN1P05305 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EDN1P05305 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDN1P05305 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDN1P05305 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDN1P05305 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDN1P05305 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDN1P05305 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDN1P05305 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDN1P05305 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDN1P05305 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EDN1P05305 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EDN1P05305 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDN1P05305 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDN1P05305 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDN1P05305 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDN1P05305 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms