Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCL10P02778 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCL10P02778 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CXCL10P02778 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms