Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC4A1P02730 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A1P02730 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A1P02730 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A1P02730 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms