Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTCP00480 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTCP00480 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTCP00480 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OTCP00480 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTCP00480 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTCP00480 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTCP00480 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTCP00480 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTCP00480 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTCP00480 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTCP00480 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTCP00480 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTCP00480 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTCP00480 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTCP00480 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTCP00480 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTCP00480 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTCP00480 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTCP00480 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTCP00480 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTCP00480 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTCP00480 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTCP00480 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTCP00480 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
OTCP00480 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
OTCP00480 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTCP00480 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTCP00480 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OTCP00480 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTCP00480 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTCP00480 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OTCP00480 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OTCP00480 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTCP00480 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTCP00480 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTCP00480 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTCP00480 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTCP00480 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTCP00480 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTCP00480 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTCP00480 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTCP00480 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTCP00480 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTCP00480 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTCP00480 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTCP00480 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTCP00480 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OTCP00480 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTCP00480 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTCP00480 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTCP00480 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTCP00480 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTCP00480 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTCP00480 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTCP00480 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTCP00480 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTCP00480 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTCP00480 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTCP00480 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTCP00480 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTCP00480 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTCP00480 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTCP00480 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTCP00480 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTCP00480 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTCP00480 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTCP00480 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTCP00480 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTCP00480 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTCP00480 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTCP00480 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTCP00480 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTCP00480 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTCP00480 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTCP00480 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTCP00480 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTCP00480 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
OTCP00480 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTCP00480 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTCP00480 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTCP00480 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
OTCP00480 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTCP00480 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTCP00480 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTCP00480 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTCP00480 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTCP00480 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTCP00480 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTCP00480 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTCP00480 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTCP00480 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTCP00480 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTCP00480 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTCP00480 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTCP00480 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTCP00480 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OTCP00480 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTCP00480 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTCP00480 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms