Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD3O95983 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD3O95983 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD3O95983 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD3O95983 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD3O95983 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD3O95983 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD3O95983 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD3O95983 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD3O95983 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD3O95983 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD3O95983 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD3O95983 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD3O95983 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD3O95983 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD3O95983 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD3O95983 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD3O95983 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD3O95983 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD3O95983 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD3O95983 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD3O95983 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD3O95983 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD3O95983 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD3O95983 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD3O95983 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD3O95983 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD3O95983 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD3O95983 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD3O95983 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD3O95983 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD3O95983 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD3O95983 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD3O95983 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD3O95983 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD3O95983 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD3O95983 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD3O95983 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MBD3O95983 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MBD3O95983 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MBD3O95983 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MBD3O95983 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MBD3O95983 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MBD3O95983 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MBD3O95983 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD3O95983 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD3O95983 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD3O95983 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD3O95983 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD3O95983 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD3O95983 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD3O95983 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD3O95983 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD3O95983 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD3O95983 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD3O95983 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD3O95983 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD3O95983 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD3O95983 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD3O95983 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD3O95983 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD3O95983 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD3O95983 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD3O95983 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD3O95983 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD3O95983 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD3O95983 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD3O95983 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD3O95983 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD3O95983 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD3O95983 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD3O95983 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD3O95983 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD3O95983 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD3O95983 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD3O95983 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD3O95983 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD3O95983 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MBD3O95983 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD3O95983 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD3O95983 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MBD3O95983 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MBD3O95983 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms