Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX7O95931 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX7O95931 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CBX7O95931 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX7O95931 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX7O95931 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX7O95931 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX7O95931 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX7O95931 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX7O95931 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CBX7O95931 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX7O95931 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX7O95931 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX7O95931 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX7O95931 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX7O95931 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CBX7O95931 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX7O95931 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX7O95931 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX7O95931 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX7O95931 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX7O95931 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX7O95931 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX7O95931 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CBX7O95931 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX7O95931 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX7O95931 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX7O95931 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX7O95931 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX7O95931 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX7O95931 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CBX7O95931 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX7O95931 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX7O95931 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX7O95931 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX7O95931 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX7O95931 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX7O95931 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX7O95931 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX7O95931 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX7O95931 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX7O95931 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CBX7O95931 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX7O95931 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX7O95931 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX7O95931 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX7O95931 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX7O95931 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX7O95931 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX7O95931 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX7O95931 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CBX7O95931 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX7O95931 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX7O95931 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX7O95931 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX7O95931 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX7O95931 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX7O95931 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX7O95931 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX7O95931 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX7O95931 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX7O95931 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBX7O95931 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX7O95931 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX7O95931 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX7O95931 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX7O95931 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX7O95931 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX7O95931 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX7O95931 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBX7O95931 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX7O95931 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX7O95931 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX7O95931 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX7O95931 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBX7O95931 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX7O95931 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX7O95931 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX7O95931 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX7O95931 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX7O95931 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX7O95931 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBX7O95931 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CBX7O95931 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX7O95931 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX7O95931 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX7O95931 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBX7O95931 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX7O95931 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX7O95931 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX7O95931 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX7O95931 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX7O95931 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX7O95931 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX7O95931 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX7O95931 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBX7O95931 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX7O95931 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX7O95931 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBX7O95931 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms