Protein–RNA interactions for Protein: O95859

TSPAN12, Tetraspanin-12, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN12O95859 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN12O95859 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN12O95859 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms