Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1O95476 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTDNEP1O95476 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms