Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN4O95460 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN4O95460 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN4O95460 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN4O95460 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN4O95460 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN4O95460 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN4O95460 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN4O95460 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN4O95460 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN4O95460 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN4O95460 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN4O95460 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MATN4O95460 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN4O95460 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN4O95460 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN4O95460 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN4O95460 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN4O95460 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN4O95460 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN4O95460 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN4O95460 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN4O95460 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN4O95460 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN4O95460 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN4O95460 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN4O95460 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MATN4O95460 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN4O95460 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN4O95460 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN4O95460 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN4O95460 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN4O95460 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN4O95460 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN4O95460 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN4O95460 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN4O95460 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN4O95460 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN4O95460 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN4O95460 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MATN4O95460 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MATN4O95460 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MATN4O95460 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MATN4O95460 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN4O95460 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN4O95460 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN4O95460 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN4O95460 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN4O95460 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN4O95460 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN4O95460 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN4O95460 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN4O95460 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MATN4O95460 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN4O95460 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN4O95460 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN4O95460 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN4O95460 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN4O95460 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN4O95460 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN4O95460 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN4O95460 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN4O95460 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MATN4O95460 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN4O95460 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN4O95460 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN4O95460 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN4O95460 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN4O95460 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN4O95460 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN4O95460 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN4O95460 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN4O95460 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN4O95460 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN4O95460 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN4O95460 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MATN4O95460 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN4O95460 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN4O95460 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN4O95460 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN4O95460 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN4O95460 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN4O95460 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN4O95460 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN4O95460 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN4O95460 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN4O95460 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MATN4O95460 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN4O95460 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN4O95460 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN4O95460 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN4O95460 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN4O95460 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN4O95460 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MATN4O95460 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MATN4O95460 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MATN4O95460 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MATN4O95460 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MATN4O95460 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MATN4O95460 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms