Protein–RNA interactions for Protein: O95394

PGM3, Phosphoacetylglucosamine mutase, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM3O95394 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGM3O95394 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGM3O95394 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGM3O95394 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGM3O95394 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGM3O95394 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGM3O95394 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGM3O95394 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGM3O95394 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGM3O95394 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGM3O95394 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGM3O95394 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGM3O95394 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGM3O95394 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGM3O95394 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGM3O95394 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PGM3O95394 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGM3O95394 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGM3O95394 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM3O95394 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM3O95394 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM3O95394 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM3O95394 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM3O95394 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM3O95394 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM3O95394 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM3O95394 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM3O95394 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGM3O95394 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGM3O95394 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM3O95394 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM3O95394 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM3O95394 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM3O95394 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM3O95394 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM3O95394 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGM3O95394 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM3O95394 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM3O95394 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM3O95394 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM3O95394 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM3O95394 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM3O95394 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM3O95394 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM3O95394 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM3O95394 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM3O95394 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGM3O95394 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM3O95394 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM3O95394 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM3O95394 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM3O95394 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM3O95394 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM3O95394 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM3O95394 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM3O95394 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PGM3O95394 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM3O95394 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM3O95394 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM3O95394 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM3O95394 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM3O95394 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGM3O95394 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM3O95394 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM3O95394 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM3O95394 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM3O95394 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM3O95394 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM3O95394 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM3O95394 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM3O95394 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM3O95394 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM3O95394 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM3O95394 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGM3O95394 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM3O95394 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM3O95394 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM3O95394 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM3O95394 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM3O95394 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM3O95394 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM3O95394 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM3O95394 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM3O95394 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM3O95394 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGM3O95394 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGM3O95394 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGM3O95394 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGM3O95394 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGM3O95394 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM3O95394 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM3O95394 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM3O95394 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM3O95394 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM3O95394 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM3O95394 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGM3O95394 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGM3O95394 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGM3O95394 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGM3O95394 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms