Protein–RNA interactions for Protein: O95049

TJP3, Tight junction protein ZO-3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TJP3O95049 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TJP3O95049 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TJP3O95049 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TJP3O95049 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TJP3O95049 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TJP3O95049 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TJP3O95049 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TJP3O95049 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TJP3O95049 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TJP3O95049 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TJP3O95049 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TJP3O95049 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TJP3O95049 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TJP3O95049 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TJP3O95049 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TJP3O95049 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TJP3O95049 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TJP3O95049 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TJP3O95049 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TJP3O95049 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TJP3O95049 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TJP3O95049 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TJP3O95049 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TJP3O95049 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TJP3O95049 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TJP3O95049 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TJP3O95049 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TJP3O95049 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TJP3O95049 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TJP3O95049 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TJP3O95049 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TJP3O95049 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TJP3O95049 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TJP3O95049 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TJP3O95049 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TJP3O95049 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TJP3O95049 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TJP3O95049 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TJP3O95049 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TJP3O95049 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TJP3O95049 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TJP3O95049 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TJP3O95049 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TJP3O95049 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TJP3O95049 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TJP3O95049 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TJP3O95049 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TJP3O95049 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TJP3O95049 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TJP3O95049 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TJP3O95049 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TJP3O95049 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TJP3O95049 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TJP3O95049 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TJP3O95049 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TJP3O95049 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TJP3O95049 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TJP3O95049 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TJP3O95049 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TJP3O95049 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TJP3O95049 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TJP3O95049 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TJP3O95049 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TJP3O95049 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TJP3O95049 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TJP3O95049 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TJP3O95049 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TJP3O95049 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TJP3O95049 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TJP3O95049 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TJP3O95049 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TJP3O95049 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TJP3O95049 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TJP3O95049 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TJP3O95049 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TJP3O95049 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TJP3O95049 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TJP3O95049 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TJP3O95049 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TJP3O95049 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TJP3O95049 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TJP3O95049 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TJP3O95049 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TJP3O95049 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TJP3O95049 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TJP3O95049 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TJP3O95049 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TJP3O95049 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TJP3O95049 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TJP3O95049 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TJP3O95049 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TJP3O95049 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TJP3O95049 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TJP3O95049 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TJP3O95049 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TJP3O95049 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TJP3O95049 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TJP3O95049 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TJP3O95049 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TJP3O95049 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms