Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF6O94906 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF6O94906 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF6O94906 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms