Protein–RNA interactions for Protein: O94900

TOX, Thymocyte selection-associated high mobility group box protein TOX, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOXO94900 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOXO94900 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOXO94900 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOXO94900 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOXO94900 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOXO94900 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOXO94900 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOXO94900 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOXO94900 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOXO94900 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOXO94900 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOXO94900 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOXO94900 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOXO94900 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOXO94900 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOXO94900 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOXO94900 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOXO94900 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOXO94900 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOXO94900 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOXO94900 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOXO94900 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOXO94900 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOXO94900 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOXO94900 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOXO94900 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOXO94900 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOXO94900 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOXO94900 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOXO94900 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOXO94900 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOXO94900 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOXO94900 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOXO94900 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOXO94900 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOXO94900 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TOXO94900 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOXO94900 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOXO94900 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOXO94900 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOXO94900 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOXO94900 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOXO94900 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOXO94900 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOXO94900 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOXO94900 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOXO94900 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOXO94900 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOXO94900 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOXO94900 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOXO94900 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOXO94900 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOXO94900 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOXO94900 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOXO94900 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOXO94900 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOXO94900 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOXO94900 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TOXO94900 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOXO94900 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOXO94900 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOXO94900 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOXO94900 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOXO94900 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOXO94900 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOXO94900 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOXO94900 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOXO94900 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TOXO94900 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TOXO94900 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TOXO94900 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOXO94900 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOXO94900 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOXO94900 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOXO94900 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOXO94900 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOXO94900 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOXO94900 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOXO94900 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOXO94900 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOXO94900 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOXO94900 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOXO94900 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOXO94900 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TOXO94900 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOXO94900 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TOXO94900 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOXO94900 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOXO94900 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOXO94900 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOXO94900 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOXO94900 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOXO94900 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TOXO94900 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOXO94900 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOXO94900 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOXO94900 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOXO94900 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOXO94900 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TOXO94900 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms