Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF4O60810 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRAMEF4O60810 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRAMEF4O60810 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms