Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTNND1O60716 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTNND1O60716 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTNND1O60716 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTNND1O60716 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTNND1O60716 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTNND1O60716 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTNND1O60716 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CTNND1O60716 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTNND1O60716 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNND1O60716 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNND1O60716 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms