Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD2O60548 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD2O60548 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD2O60548 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms