Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EXTL3O43909 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXTL3O43909 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXTL3O43909 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms