Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRKAB2O43741 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRKAB2O43741 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRKAB2O43741 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRKAB2O43741 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms