Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
FOXO3O43524 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
FOXO3O43524 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FOXO3O43524 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FOXO3O43524 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms