Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAD51CO43502 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD51CO43502 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD51CO43502 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms