Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF4O43474 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF4O43474 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF4O43474 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF4O43474 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF4O43474 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF4O43474 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF4O43474 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF4O43474 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF4O43474 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF4O43474 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF4O43474 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF4O43474 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF4O43474 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF4O43474 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF4O43474 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF4O43474 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF4O43474 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF4O43474 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF4O43474 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF4O43474 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF4O43474 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLF4O43474 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLF4O43474 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF4O43474 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLF4O43474 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF4O43474 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLF4O43474 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF4O43474 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF4O43474 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLF4O43474 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLF4O43474 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLF4O43474 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLF4O43474 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLF4O43474 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF4O43474 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF4O43474 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLF4O43474 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF4O43474 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF4O43474 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF4O43474 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF4O43474 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF4O43474 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF4O43474 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF4O43474 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF4O43474 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF4O43474 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KLF4O43474 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF4O43474 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF4O43474 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLF4O43474 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF4O43474 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF4O43474 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF4O43474 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF4O43474 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF4O43474 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF4O43474 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF4O43474 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF4O43474 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF4O43474 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF4O43474 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF4O43474 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLF4O43474 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF4O43474 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF4O43474 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF4O43474 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLF4O43474 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF4O43474 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF4O43474 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF4O43474 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF4O43474 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF4O43474 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF4O43474 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF4O43474 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF4O43474 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF4O43474 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF4O43474 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF4O43474 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF4O43474 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF4O43474 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF4O43474 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF4O43474 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF4O43474 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF4O43474 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF4O43474 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF4O43474 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF4O43474 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF4O43474 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF4O43474 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF4O43474 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF4O43474 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF4O43474 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF4O43474 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF4O43474 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF4O43474 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF4O43474 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF4O43474 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF4O43474 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF4O43474 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF4O43474 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms