Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATMINO43313 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATMINO43313 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATMINO43313 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATMINO43313 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATMINO43313 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATMINO43313 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATMINO43313 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATMINO43313 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATMINO43313 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATMINO43313 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATMINO43313 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATMINO43313 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATMINO43313 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATMINO43313 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATMINO43313 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATMINO43313 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATMINO43313 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATMINO43313 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATMINO43313 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATMINO43313 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATMINO43313 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATMINO43313 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATMINO43313 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATMINO43313 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATMINO43313 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATMINO43313 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATMINO43313 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATMINO43313 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATMINO43313 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATMINO43313 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATMINO43313 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATMINO43313 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATMINO43313 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATMINO43313 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATMINO43313 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATMINO43313 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATMINO43313 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATMINO43313 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATMINO43313 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATMINO43313 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATMINO43313 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATMINO43313 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATMINO43313 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATMINO43313 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATMINO43313 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATMINO43313 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATMINO43313 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATMINO43313 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATMINO43313 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATMINO43313 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATMINO43313 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATMINO43313 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATMINO43313 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATMINO43313 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATMINO43313 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATMINO43313 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATMINO43313 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATMINO43313 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATMINO43313 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATMINO43313 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATMINO43313 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATMINO43313 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATMINO43313 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATMINO43313 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATMINO43313 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATMINO43313 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATMINO43313 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATMINO43313 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATMINO43313 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATMINO43313 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATMINO43313 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATMINO43313 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATMINO43313 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATMINO43313 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATMINO43313 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATMINO43313 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATMINO43313 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATMINO43313 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATMINO43313 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATMINO43313 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATMINO43313 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATMINO43313 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATMINO43313 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATMINO43313 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATMINO43313 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATMINO43313 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATMINO43313 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATMINO43313 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATMINO43313 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATMINO43313 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATMINO43313 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATMINO43313 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATMINO43313 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATMINO43313 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATMINO43313 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATMINO43313 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATMINO43313 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATMINO43313 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATMINO43313 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms