Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRODHO43272 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRODHO43272 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRODHO43272 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRODHO43272 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRODHO43272 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRODHO43272 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRODHO43272 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRODHO43272 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRODHO43272 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRODHO43272 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRODHO43272 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRODHO43272 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRODHO43272 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRODHO43272 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRODHO43272 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRODHO43272 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRODHO43272 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRODHO43272 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRODHO43272 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRODHO43272 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRODHO43272 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRODHO43272 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRODHO43272 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRODHO43272 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRODHO43272 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRODHO43272 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRODHO43272 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRODHO43272 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRODHO43272 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRODHO43272 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRODHO43272 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRODHO43272 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRODHO43272 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRODHO43272 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRODHO43272 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRODHO43272 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRODHO43272 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRODHO43272 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRODHO43272 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRODHO43272 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRODHO43272 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRODHO43272 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRODHO43272 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRODHO43272 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRODHO43272 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRODHO43272 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRODHO43272 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRODHO43272 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRODHO43272 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRODHO43272 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRODHO43272 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRODHO43272 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRODHO43272 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRODHO43272 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRODHO43272 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRODHO43272 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRODHO43272 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRODHO43272 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRODHO43272 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRODHO43272 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRODHO43272 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRODHO43272 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRODHO43272 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRODHO43272 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRODHO43272 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRODHO43272 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRODHO43272 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRODHO43272 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRODHO43272 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRODHO43272 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRODHO43272 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRODHO43272 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRODHO43272 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRODHO43272 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRODHO43272 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRODHO43272 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRODHO43272 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRODHO43272 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRODHO43272 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRODHO43272 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRODHO43272 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRODHO43272 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRODHO43272 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRODHO43272 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRODHO43272 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRODHO43272 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRODHO43272 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRODHO43272 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRODHO43272 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRODHO43272 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRODHO43272 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRODHO43272 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRODHO43272 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRODHO43272 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRODHO43272 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRODHO43272 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRODHO43272 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRODHO43272 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRODHO43272 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.5 ms