Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SGSM2O43147 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGSM2O43147 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SGSM2O43147 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms