Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBDO15205 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBDO15205 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBDO15205 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBDO15205 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBDO15205 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBDO15205 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBDO15205 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBDO15205 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBDO15205 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBDO15205 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBDO15205 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBDO15205 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBDO15205 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBDO15205 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBDO15205 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBDO15205 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBDO15205 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBDO15205 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBDO15205 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBDO15205 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBDO15205 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBDO15205 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBDO15205 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBDO15205 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBDO15205 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBDO15205 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBDO15205 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBDO15205 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBDO15205 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBDO15205 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBDO15205 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBDO15205 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBDO15205 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBDO15205 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBDO15205 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBDO15205 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBDO15205 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBDO15205 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBDO15205 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBDO15205 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBDO15205 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBDO15205 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBDO15205 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBDO15205 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBDO15205 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBDO15205 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBDO15205 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBDO15205 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBDO15205 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBDO15205 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBDO15205 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBDO15205 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBDO15205 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBDO15205 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBDO15205 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBDO15205 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBDO15205 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBDO15205 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBDO15205 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBDO15205 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBDO15205 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBDO15205 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBDO15205 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBDO15205 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBDO15205 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBDO15205 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBDO15205 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBDO15205 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBDO15205 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBDO15205 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBDO15205 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBDO15205 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBDO15205 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBDO15205 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBDO15205 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBDO15205 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBDO15205 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBDO15205 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBDO15205 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBDO15205 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBDO15205 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBDO15205 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBDO15205 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBDO15205 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBDO15205 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBDO15205 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBDO15205 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBDO15205 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBDO15205 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBDO15205 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBDO15205 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBDO15205 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBDO15205 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBDO15205 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBDO15205 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBDO15205 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBDO15205 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBDO15205 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBDO15205 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms