Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN9O14815 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN9O14815 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms