Protein–RNA interactions for Protein: O00746

NME4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4O00746 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME4O00746 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME4O00746 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NME4O00746 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME4O00746 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME4O00746 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME4O00746 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME4O00746 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME4O00746 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME4O00746 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME4O00746 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME4O00746 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME4O00746 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME4O00746 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME4O00746 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME4O00746 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME4O00746 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME4O00746 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME4O00746 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME4O00746 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME4O00746 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME4O00746 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME4O00746 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME4O00746 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME4O00746 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME4O00746 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME4O00746 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME4O00746 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME4O00746 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME4O00746 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME4O00746 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME4O00746 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME4O00746 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME4O00746 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NME4O00746 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME4O00746 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME4O00746 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME4O00746 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME4O00746 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME4O00746 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME4O00746 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME4O00746 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME4O00746 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME4O00746 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME4O00746 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME4O00746 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME4O00746 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME4O00746 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME4O00746 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME4O00746 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME4O00746 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME4O00746 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME4O00746 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME4O00746 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME4O00746 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME4O00746 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME4O00746 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME4O00746 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME4O00746 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME4O00746 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME4O00746 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME4O00746 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME4O00746 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME4O00746 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME4O00746 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME4O00746 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME4O00746 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME4O00746 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME4O00746 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME4O00746 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NME4O00746 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME4O00746 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME4O00746 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME4O00746 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME4O00746 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NME4O00746 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NME4O00746 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NME4O00746 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME4O00746 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NME4O00746 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME4O00746 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NME4O00746 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NME4O00746 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NME4O00746 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms