Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MEIS1O00470 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEIS1O00470 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MEIS1O00470 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms